铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民管辖。
因此在确定管辖时，运输合同履行地应为运输始发地、目的地。
一、管辖确定的原则
运输合同纠纷较一般合同纠纷复杂，它涉及到承运人是否正确履行合同、是否造成货物毁损、是否按时运到，收货人是否履行收货义务等。从便利审判与诉讼以及存在实际联系的角度出发，运输合同纠纷由运输始发地、目的地或被告住所地管辖是适宜的。目的地是指客、货运输的最终到达地。
运输合同可能是单一的运输工具来完成，比如由路上运输或者水上运输或者空中运输单独完成，也有可能采取的是多种运输工具联合运输，路上运输还存在公路运输和铁路运输之分。
采用不同的运输工具，就可能形成是由普通管辖还是由专门管辖的问题。实践中处理这一问题的基本原则是：
1、如果是采用单一运输工具，则按运输工具不同来确定管辖，比如采用水运，则由海事管辖，采用铁路运输，则由铁路运输管辖；
2、如果是采取联合运输，根据具体情况，凡是与海事有关的，由海事管辖，与铁路运输有关的，由铁路运输管辖；
3、在联合运输中，如果同时存在水运和铁路运输的，如何确定管辖，法律并未作出具体规定，在这处情况下，可以由当事人选择管辖。
二、《民事诉讼法》对于合同诉讼的管辖规定
第二十七条因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民管辖。
第二十因侵权行为提起的诉讼，由侵权行为地或者被告住所地人民管辖。
第二十九条因铁路、公路、水上和航空事故请求损害赔偿提起的诉讼，由事故发生地或者车辆、船舶最先到达地、航空器最先降落地或者被告住所地人民管辖。
第三十条因船舶碰撞或者其他海事损害事故请求损害赔偿提起的诉讼，由碰撞发生地、碰撞船舶最先到达地、加害船舶被扣留地或者被告住所地人民管辖。
第三十一条因海难救助费用提起的诉讼，由救助地或者被救助船舶最先到达地人民管辖。
第三十二条因共同海损提起的诉讼，由船舶最先到达地、共同海损理算地或者航程终止地的人民管辖。
第三十三条下列案件，由本条规定的人民专属管辖：
（一）因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民管辖；
（二）因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民管辖；
（三）因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民管辖。
第三十四条合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。
第三十五条两个以上人民都有管辖权的诉讼，原告可以向其中一个人民起诉；原告向两个以上有管辖权的人民起诉的，由最先立案的人民管辖。
三、其他特殊合同由法律规定的管辖
1、因保险合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者保险标的物所在地人民管辖。如果保险标的物是运输工具或者运输中的货物，由被告住所地或者运输工具登记注册地、运输目的地、保险事故发生地的人民管辖。
2、因票据纠纷提起的诉讼，由票据支付地或者被告住所地人民管辖。票据支付地，是指票据上载明的付款地。票据未载明付款地的，票据付款人（包括代理付款人）的住所地或主营业所所在地为票据付款地。
3、因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民管辖。
4、因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民管辖。